Akgündüz ageerde op de Turkse tv tegen wat hij noemt een "Europese islam" waar tot zijn ongenoegen ruimte is voor homo's en vrouwelijke imams. Ook zei hij dat tegenstanders van president Erdogan volgens de Koran mogen worden gedood.

Van Engelshoven heeft een commissie ingesteld die de uitspraken onderzoekt. De rector is eerder in opspraak gekomen door extreme uitspraken over Koerden, Joden en homoseksuelen.